Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZEB1P37275 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms