Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms