Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD12P35452 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms