Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC1P35052 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms