Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFNP31947 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFNP31947 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFNP31947 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFNP31947 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms