Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC12P31275 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms