Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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