Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCAP28676 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GCAP28676 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCAP28676 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms