Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms