Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMLP26374 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMLP26374 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMLP26374 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMLP26374 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMLP26374 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms