Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPREP23469 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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