Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms