Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPRAP18433 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTPRAP18433 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PTPRAP18433 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRAP18433 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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