Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFAP15692 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFAP15692 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms