Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD46P15529 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD46P15529 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD46P15529 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD46P15529 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD46P15529 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD46P15529 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD46P15529 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD46P15529 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD46P15529 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD46P15529 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms