Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABRA1P14867 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRA1P14867 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms