Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHGAP10645 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHGAP10645 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHGAP10645 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHGAP10645 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHGAP10645 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHGAP10645 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHGAP10645 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHGAP10645 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHGAP10645 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHGAP10645 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHGAP10645 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHGAP10645 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHGAP10645 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHGAP10645 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms