Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM225BP0DP42 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms