Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMIGD3P0DMS9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms