Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms