Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP10P09238 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP10P09238 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP10P09238 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP10P09238 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP10P09238 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP10P09238 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms