Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJB1P08034 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms