Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEFLP07196 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms