Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOA4P06727 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms