Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTMAP06454 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTMAP06454 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTMAP06454 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms