Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TK1P04183 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TK1P04183 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TK1P04183 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TK1P04183 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TK1P04183 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms