Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOA1P02647 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOA1P02647 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOA1P02647 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms