Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CBX7O95931 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBX7O95931 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms