Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIOO75962 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIOO75962 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms