Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms