Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms