Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL41O60662 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL41O60662 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms