Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms