Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL13O43927 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms