Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA2O43921 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms