Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC11O43248 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC11O43248 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms