Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PER1O15534 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PER1O15534 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PER1O15534 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PER1O15534 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PER1O15534 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PER1O15534 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms