Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARPC1BO15143 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms