Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNMO15061 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYNMO15061 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNMO15061 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNMO15061 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNMO15061 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNMO15061 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNMO15061 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms