Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms