Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCER2I3L3R5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms