Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL13PA6NNM8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL13PA6NNM8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL13PA6NNM8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL13PA6NNM8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TTLL13PA6NNM8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL13PA6NNM8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms