Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCP1A6NGW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms