Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRIT2A6NDA9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms