Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms