Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX8Q9Y5X2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms