Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLF13Q9Y2Y9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms