Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDCQ9Y266 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms