Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC5Q9UQL6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms