Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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